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OriBinder 使用说明

上传蛋白质 PDB 文件,指定结合口袋位置,系统将自动生成候选结合体。支持 .pdb、.cif、.sdf、.mol 格式。

OriBinder 是基于深度生成模型的蛋白质-配体结合体设计工具,能够针对指定的蛋白质口袋自动生成高亲和力的候选结合分子。

输入要求

上传目标蛋白质结构文件(支持 .pdb、.cif、.sdf、.mol 格式,最大 50MB)。在「指定口袋位置」区域填写链 ID、残基范围或中心坐标和半径来定义结合口袋。

高级参数

可选配置采样数量(默认 10)、温度参数(控制生成多样性,默认 1.0)和随机种子(用于结果复现)。

结果解读

任务完成后,输出区将展示生成的结合体 3D 结构可视化。每个候选分子附带置信度评分和预测结合能(kcal/mol)。您可以下载 PDB 文件进行后续分析。

积分消耗

每次任务消耗 10-50 积分,取决于蛋白质大小和采样数量。批量任务建议使用项目管理功能统一管理。